クロガネモチは非常に萌芽力（新芽を吹く力）が強く、放っておくと年間で50cm以上も枝を伸ばし、樹高10m近くまで達する常緑高木です。一般家庭の庭で美しく維持するためには、「どこを切るか」の基準を明確にする必要があります。
基本となるのは、日照と通気性を確保する透かし剪定と、樹高の上限を決める芯止め（しんどめ）の2つの技術です。
まず切り落とすべき「忌み枝（不要枝）」の選別基準は以下の通りです。
- 徒長枝（とちょうし）：幹や太い枝から真上に向かって勢いよく一直線に伸びる枝。養分を奪い樹形を乱すため根元から切除します。
- 立ち枝・逆さ枝：内側に向かって伸びる枝や、不自然に交差して他の枝を傷つける枝。
- 平行枝・重なり枝：同じ方向に上下で平行して伸びている枝のうち、日陰を作っている一方を間引きます。
- ひこばえ（ヤゴ）：地面に近い幹の根元から生えてくる細い枝。木全体の活力を削ぐため見つけ次第切り取ります。
枝を切る際は、中途半端な位置で切るのではなく、枝の分岐点（生え際）のすぐ外側で切るのが鉄則です。枝の途中で切ると、その切り口から複数の細い枝が放射状に噴き出し、かえって枝葉が過密になってしまいます。
大きくなりすぎた木をこれ以上高くしたくない場合は、主幹の先端を切り落とす芯止めを行います。好みの高さにある「横方向に伸びる元気な枝」のすぐ上で主幹を水平または斜めに切断します。これにより頂部への養分集中が抑えられ、横枝への成長エネルギーへと分散させることができます。太い切り口には、必ず癒合剤（トップジンMペーストなど）を塗布し、雨水の侵入による腐朽菌の繁殖を防ぐことが長持ちの秘訣です。
