漫画家としての不動の地位を築くなかで、サンライズ制作の大ヒットアニメ『機動戦士ガンダム00』におけるメインキャラクターデザイン原案への起用は、アニメ界全体に大きなニュースとして駆け巡った。伝統あるガンダムシリーズにおいて、女性漫画家が主要キャラクター群のビジュアルを一手に引き受ける試みは極めて野心的だった。
監督を務めた水島精二とのやり取りは、まさに知性と感性がぶつかり合う密密なコラボレーションだったという。兵士としての冷徹さと、少年らしい危うさを同居させた刹那・F・セイエイらの造形は、高河ゆんの美学とサンライズの持つ骨太なミリタリー要素が融合した最高傑作となった。
