事態を重く受け止めた京都府警察は、直ちに捜査本部を拡充し、異例とも言える大規模な特別捜査体制を確立した。それが「京都男児行方不明捜査プロジェクト」である。京都府全域の警察署から選抜されたベテラン捜査員や鑑識課員が集結し、広大な山林地帯から都市部の空き家、さらには河川敷に至るまで、徹底的な捜索が連日実施されている。
最新の捜査状況によれば、警察はNシステム（自動車ナンバー自動読取装置）の解析や、周辺を通過した数百台のドライブレコーダー映像の回収を完了。画像解析技術を駆使して、男児の失踪時間帯に現場付近に存在したすべての車両と人物の特定を進めている。科学捜査の粋を集めた追尾作業は、事件の闇を照らし出す確かな一手となりつつある。
