日本薬科大学は、埼玉県伊奈町の「さいたまキャンパス」と、東京都文京区湯島の「お茶の水キャンパス」という2つの拠点を展開しています。両キャンパスは役割と設置学科が明確に分かれており、志望動機に応じた選択が求められます。
さいたまキャンパスは、国家資格を目指す薬学科（6年制・医療薬学専攻など）を中心とした総合研究拠点です。大型の分析機器や研究棟、薬用植物園、体育施設が集中し、腰を据えて実験・臨床研究に打ち込める環境が整備されています。
一方のお茶の水キャンパスは、都心のアクセスの良さを活かした医療ビジネス薬科学科（4年制）の主要講義や、社会人向け公開講座、学術シンポジウムなどの発信拠点として機能しています。製薬企業のマーケティングや医療事務、ヘルスケアビジネスを目指す文理融合型の学びにはお茶の水が適しており、薬剤師免許の取得を目指して高度な実験実習を積む場合はさいたまキャンパスが主たる学び舎となります。
