スマホで青色申告を完了させる基本的な入力手順は、大きく4つのステップに分かれます。事前の帳簿集計が済んでいれば、画面遷移に従ってスムーズに入力を進められます。
最初のステップは、青色申告決算書（損益計算書・貸借対照表）の作成です。事業所得に関する総収入金額や売上原価、地代家賃・通信費・減価償却費などの経費項目を入力し、事業の損益を確定させます。続いて、期首と期末の資産・負債を入力して貸借対照表を完成させます。
次のステップでは、確定申告書の入力に進みます。決算書で算出した事業所得が自動的に引き継がれるため、国民健康保険料や国民年金などの社会保険料控除、生命保険料控除、ふるさと納税（寄附金控除）などの各種控除データを追加します。
最後に、マイナンバーカードをスマートフォンの背面に密着させて電子署名を付与し、国税庁のサーバーへデータを送信します。送信後に発行される「受信通知（受付結果）」を確認し、PDFデータを端末やクラウドへ保存すれば申告手続きは完了です。なお、e-Tax送信を利用することで、医療費の領収書や各種控除証明書などの添付書類の提出を省略できるという大きなメリットも享受できます。
